يحتوي مستشفى الامير علي بن الحسين على الاختصاصات الرئيسيه التاليه :

1. الباطنيه العامه
2. الجراحه العامه
3. النسائيه و التوليد
4. الاطفال

كما و يحتوي المستشفى على الاختصاصات الفرعيه التاليه:
1. العيون
2. الاذنيه
3. النفسيه
4. المفاصل
5. المختبر
6. العظام
7. التخدير و الانعاش
8. الجلديه
9. الاشعه
10. قسم الاسنان.
 

يغطى المستشفى من قبل اطباء المستشارين الزائرين من مدينه الحسين الطبيه بالعيادات التاليه :

1. المفاصل الرثويه
2. جراحه المسالك
3. جراحه الاطفال
4. الصدريه
5. القلب ( الكبار و الصغار )
6. جراحه الاعصاب
7. الباطنيه اعصاب
8. الغدد الصماء و السكري
9. تقويم اسنان
10. الكلى .